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3ª Regional (Grupo D)
Clasificación de la temporada 06/13
| Puesto | Equipo | Partidos | Puntos | Potencia | Goles | DG | V | E | D |
| 1 | Huércal-Overa CF | 34 | 79 | 378 | 74 : 21 | 53 | 24 | 7 | 3 |
| 2 | UP Plasencia | 34 | 67 | 357 | 56 : 36 | 20 | 21 | 4 | 9 |
| 3 | Zalla UC | 34 | 65 | 374 | 66 : 31 | 35 | 19 | 8 | 7 |
| 4 | Moralo CP | 34 | 65 | 359 | 56 : 38 | 18 | 19 | 8 | 7 |
| 5 | Atlético Villanueva | 34 | 61 | 336 | 57 : 40 | 17 | 18 | 7 | 9 |
| 6 | CD Cortes | 34 | 60 | 351 | 51 : 39 | 12 | 17 | 9 | 8 |
| 7 | Atlético Benamiel | 34 | 58 | 364 | 48 : 29 | 19 | 16 | 10 | 8 |
| 8 | CD Corralejo | 34 | 55 | 344 | 48 : 34 | 14 | 15 | 10 | 9 |
| 9 | Los Villares CF | 34 | 47 | 326 | 44 : 44 | 0 | 13 | 8 | 13 |
| 10 | Extremadura UD | 34 | 45 | 337 | 40 : 39 | 1 | 10 | 15 | 9 |
| 11 | Montilla CF | 34 | 45 | 337 | 38 : 42 | -4 | 12 | 9 | 13 |
| 12 | Badajoz CF | 34 | 40 | 321 | 39 : 52 | -13 | 11 | 7 | 16 |
| 13 | CD Idoya | 34 | 35 | 327 | 37 : 51 | -14 | 9 | 8 | 17 |
| 14 | CD Aoiz | 34 | 34 | 305 | 28 : 46 | -18 | 8 | 10 | 16 |
| 15 | Brenes Balompié | 34 | 26 | 312 | 27 : 56 | -29 | 6 | 8 | 20 |
| 16 | Pasaia KE | 34 | 23 | 304 | 38 : 67 | -29 | 5 | 8 | 21 |
| 17 | Gernika Club SD | 34 | 23 | 290 | 22 : 64 | -42 | 5 | 8 | 21 |
| 18 | CA Cirbonero | 34 | 14 | 305 | 34 : 74 | -40 | 2 | 8 | 24 |